Факультеты Московского университета сотрудничают со школами, находящимися в городе Москве, и со школами, расположенными в других городах Российской Федерации.
Механико-математический факультет
- ГБОУ города Москвы СОШ № 2086 (http://sch2086uz.mskobr.ru, http://www.sch25.ru),
- ГБОУ города Москвы «Школа № 171» (http://sch171c.mskobr.ru, http://www.moscowschool54.ru),
- ГБОУ города Москвы «Школа № 1434 «Раменки»» (http://sch1434.mskobr.ru).
Физический факультет
- ГБОУ города Москвы «Лицей № 138» (http://sch138sz.mskobr.ru);
- ГБОУ города Москвы СОШ № 2031 (http://sch2031.mskobr.ru);
- ГБОУ города Москвы СОШ с углубленным изучением математики, информатики, физики № 444 (http://schv444.mskobr.ru);
- ФГКОУ «Московский кадетский корпус «Пансион воспитанниц Министерства обороны Российской Федерации»» (http://pansion-mil.ru);
- ГБОУ города Москвы лицей «Вторая школа» (http://lycuz2.mskobr.ru, http://www.sch2.ru);
- ГБОУ города Москвы СОШ № 1935 (http://sch1935uv.mskobr.ru);
- ГБОУ города Москвы «Школа № 37» (http://sch37.mskobr.ru);
- ГБОУ города Москвы «Школа № 15» (http://sch15uz.mskobr.ru);
- ГБОУ города Москвы «Гимназия № 1507» (http://gym1507uz.mskobr.ru);
- ГБОУ города Москвы «Школа с углубленным изучение английского языка № 1279» (http://sch1279.mskobr.ru);
- ГБОУ города Москвы «Школа № 1434 «Раменки»» (http://sch1434.mskobr.ru);
- ГБОУ города Москвы лицей информационных технологий № 1537 (http://lyc1537.mskobr.ru),
- ГБОУ города Москвы «Школа № 1468» (http://sch1468.mskobr.ru),
- МБОУ «Физико-математический лицей» (город Сергиев Посад, Московская область) (http://фмл.рф),
- МОАУ «Лицей № 1» городского округа город Нефтекамск Республики Башкортостан (http://lyceum.neftekamsk.ru)
- МОУ «Гуманитарно-педагогический лицей» (город Ухта, Республика Коми) (http://www.uhtagpl.ru)
- МБОУ СОШ с углублённым изучением отдельных предметов № 15 города-курорта Кисловодска (Ставропольский край) (http://школа15.рф).
- МБОУ «СОШ № 57 с углубленным изучением отдельных предметов» города Чебоксары Чувашской Республики (http://www.21203s21.edusite.ru),
- МБОУ «Лицей № 2» города Чебоксары Чувашской Республики (http://liceum2.moy.su).